| 党政机构 | ||
|---|---|---|
| 教职工监督委员会 | 党委办公室 | 校长办公室（下设外事办、校友办） |
| 组织人事部 | 宣传新闻部（校报编辑部） | 统战部 |
| 纪检监察审计室 | 教务部（招生办公室） | 科研部（研究生部） |
| 国有资产监督管理部 | 财务管理中心 | 学生工作部（就业指导中心） |
| 保卫部（武装部） | 质量控制办公室 | 离退休工作部 |
| 发展与改革研究中心 | 计划生育工作办公室 | 医学教育研究所 |
| 群团组织 | ||
| 工会（妇女联合会） | 团委 | |
| 科研机构 | ||
| 海南省热带病重点实验室 | 海南省热带药用植物研究开发重点实验室 | 海南医学院科学实验中心 |
| 海南省干细胞研究所 | 海南省艾滋病研究中心 | 海南省免疫学会 |
| 海南省热带医学研究会 | ||
| 附属医院 | ||
| 海南医学院附属医院 | ||
| 其他机构 | ||
| 图书馆（海南省医学信息研究所） | 网络管理中心 | 档案馆 |
| 杂志社 | 后勤服务总公司 | 海南岛养生科学与旅游医学研究院 |
| 海南省药物安全性评价研究中心 | ||
